在王智涛将领履历当中，军科院是他军事生涯中最后一站。

新中国成立后，先在空军训练部担任参谋长，后调任上海防空司令部担任副司令，又的男人防空学校校长，高级防空学校校长。1960年被迫离开空军，被叶帅要去军科院工作。

在军科院实际工作时间并不长，到1964年因身体不适而休养。后来身体好一些后，要去回来工作，叶帅表示多休息。紧接着一场大运动降至，使得他想回都回不去了。

随着运动深入展开，粟裕调去副职国防工业军管，宋时轮中断工作，王树声任书记临时负责。王智涛因为不在职，成了“逍遥派”。虽然也去军科院报到，但没有具体工作主要是学习，看看报纸，看看书，晚上到点下班。

1968年下半年，他受到冲击，被扣上不少帽子。1969年，因为战备在京的靠边站的老将被疏散到外地，王智涛被放到山西榆次，在干休所安家。

1971年6月，从子女口中得知政策要落实，建议他到北京去争取，并找军科院党委提出平反。他以看病为由，去了北京。见到在职的老战友、老领导们。对于他要求平反，老首长表示目前情况不允许，需要大背景变化才行。

他向军科院党委提出要求做结论，要求回北京的树木报告呈递，单位没有做出任何回应，正如老首长所说，时间不成熟。虽然没有回音，可他执意要留下，只有留下问题才能尽快解决，到山西榆次消息闭塞。在老战友的帮助下借到一套三居室房子住下。可随着儿女都来，三居室不够住，发现过去的老房子一直空置，而且贴着封条。

他索性就把封条拿下，打扫后就住进去了。他可是有理有据，才这样干的。可此时房屋归属并不属于他，是国务院机关事务管理局负责，发现后向军科院告状，要他立即搬离。

为解决问题，军科院集体约他谈话，在座的有刚刚担任院长的宋时轮，第一政委粟裕，以及其他常委。有人说他无组织，无纪律，擅自回京，撬开铁锁占房子。主持人是宋时轮，让他说说为什么这样做呢？

王智涛把自己的情况一股脑儿说出来，自己被审查和关押，扣不少帽子，为什么不将审查结果公布，含糊说内部矛盾就结论了。自己离开北京，去山西是介绍信是行政七级，职务军科院副秘书长这说明自己恢复待遇，也有结论，怎么不公布，而且自己也申请，未予理睬。

这本来就是自己的家，过去封了，我造你们一回反，自行迁回旧居，有什么不对。对于他的陈述后，宋时轮和粟裕都没有表态，也等于默许他回旧居，可有人问粟裕意见，粟裕说难道还把他再关起来？其他人也没话可说，就散会了。

散会后，宋时轮笑着说：你老兄胆子不小，还敢舌战群儒。

军科院主官没有多说什么，这件事也就不了了之，也算留在北京。1978年，他才恢复工作，担任军科院顾问，发挥余热。